Le Dédale arrive pour défendre Atlantis de l'attaque des Wraichs, mais il ne peut pas être assez quand l'équipe découvre qu'une même plus grande armada est sur la voie.

- Sortie : 15 juillet 2005, : 15 Avril 2005

Le Daedalus est infecté par un virus informatique des Wraichs, tandis que les membres de l'expédition espèrent retourner sur la Terre.

- Sortie : 16 Juillet 2004, : 15 Avril 2005

Sheppard et son  d'équipe font une tentative pour localiser le Lieutenant Ford, ils ont  trouver aussi un captifs  qui est chassé par les Wraichs.

- Sortie : 29 juillet 2005, : 15 Avril 2005

Une exécuter-dans avec technologie des Wraichs laisse la connaissance d' un officier de sécurité précoce dans Dr. McKay dérange.

- Sortie : 5 août 2005, : 15 Avril 2005

L'équipe d'Atlantis arrive sur une planète qui vit en relative harmonie avec un Wraith. Les habitants livrent leurs prisonniers et criminels aux Wraiths pour être en paix.

- Sortie : 12 août 2005, : 15 Avril 2005

McKay met l'équipe à risque quand il essais pour technologie Antique inachevée parfaite cela wiped hors une civilisation. Ronan Dex découvrent qu'des nombre de ses petits gens survivaient l'attaque d'Apparition, son entraîneur militaire ancien inclus.

- Sortie : 19 août 2005, : 15 Avril 2005

L'équipe découvre une jeune fille Wraich qui est élevée par un être humain, et sont dans masqués à partir de les gens de ses village humainne dans peur de sa vie.

- Sortie : 26 août 2005, : 15 Avril 2005

Colonel Sheppard commence de subir un inquiète transformation physique.

- Sortie : 9 septembre 2005, : 15 Avril 2005

Quand l'équipe découvre un vaisseau Ancient, McKay et Sheppard sont surpris de découvrir que l'équipage à bord connait une faiblesse à propos de la téchnologie Wraith.

- Sortie : 23 septembre 2005, : 15 Avril 2005

L'équipe est capturée par le Lt Ford, qui dirige un groupe de personnes comme lui qui ont besoin de récupèrer l'enzyme des Wraiths.

- Sortie : 23 septembre 2005, : 15 Avril 2005

McKay doit entamer une course contre la montre pour sauver Sheppard, Teyla et Ronan capturés et retenus en otage à bord d´un vaisseau ruche.

- Sortie : 21 novembre 2005, : 15 Avril 2005

Sheppard se retrouve coincé sur une planète où le temps passe plus rapidement, sans possibilité de contacter son équipe ou de rejoindre Atlantis.

- Sortie : 28 novembre 2005, : 15 Avril 2005

Lorsque qu'une balise est activée depuis la cité, alertant les Wraith de sa présence, les soupçons se portent vers un nouvel arrivant de la Terre.

- Sortie : 5 décembre 2005, : 15 Avril 2005

Quand le Docteur McKay se retrouve prisonnier d’un Jumper en perdition dans l’océan, il doit compter sur Samantha Carter pour survivre.

- Sortie : 12 décembre 2005, : 15 Avril 2005

L'équipe de Sheppard trouve une planète capable de se protéger des Wraiths grâce à une technologie Ancienne, mais John est vite mêlé à des conflits entre les héritiers de la famille royale.

- Sortie : 19 décembre 2005, : 15 Avril 2005

Sheppard et Weir deviennent une menace pour Atlantis quand leurs esprits se retrouvent sous le contrôle de deux êtres hostiles.

- Sortie : 2 janvier 2006, : 15 Avril 2005

Alors que l'équipe apprend que les Genii se montrent de nouveau menaçant, ils réalisent que la trêve avec leur ancien ennemi pourrait bien prendre fin.

- Sortie : 9 janvier 2006, : 15 Avril 2005

Un jeune Lieutenant amnésique fait une découverte perturbante à son sujet : il est un Wraith transformé par le rétrovirus du Docteur Beckett..

- Sortie : 16 Juillet 2004, : 15 Avril 2005

l'équipe découvre une base Ancienne occupée par les autochtones. Mais le volcan dans lequel elle se trouve va se réveiller, menaçant de détruire le complexe.

- Sortie : 23 janvier 2006, : 15 Avril 2005

L'équipe d'Atlantis est suprise de voir Michael revenir à bord d'un vaisseau ruche : il leur révèle que les Wraiths sont en pleine guerre civile et il leur propose une alliance dans le but d'affaiblir leurs ennemis.

- Sortie : 30 janvier 2006, : 15 Avril 2005